1934年7月26日,马福邦出生于广东广州。
1951年9月,考入北京大学。
1952年9月,转入清华大学电机系。
1954年11月,加入中国共产党。
1955年9月,从清华大学电机系毕业,后分配到二机部工作。
1980年10月—1983年6月,任二机部原子能所堆工部副主任。
1983年6月—1984年7月,任核工业部原子能所副所长。
1984年7月—1986年6月,任核工业部科技核电局副局长。
1986年6月—1988年6月,任核工业部核电局局长。
1987年7月,任核工业部党组成员。
1988年6月—1993年5月,任中国核工业总公司党组成员、总经理助理、核电局局长。
1993年5月—1999年7月,任中国核工业总公司总工程师。
1994年,当选为中国工程院院士。
2004年5月30日,在杭州逝世,享年70岁。