1937年5月24日，孙玉发出生于黑龙江省嫩江市，籍贯是黑龙江省黑河市嫩江县。
1957年9月至1963年7月，在哈尔滨工业大学学习反应堆工程专业。
1963年7月至1965年5月，在国防部第七研究院第三研究所工作。
1965年5月至1967年9月，在核工业部第一研究设计院工作。
1967年9月至1970年10月，在核工业第一研究设计院担任专业组长。
1970年10月至1983年10月，在核工业第一研究设计院担任研究室副主任，主任。
1983年10月至1985年3月，在核工业第一研究设计院堆工所先后担任副所长，所长。
1984年7月至1984年9月，作为西德西门子公司核电开发部访问学者。
1985年3月至1987年7月，在核工业第一研究设计院工作。
1987年7月至2000年7月，担任中国核动力研究设计院副院长。
1999年，当选为中国工程院院士。
2000年7月，担任中国核动力研究设计院科学技术委员会主任。
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